黄锈石荒料门牌石水斑为碱-硅酸凝胶体。显微镜可明显观察到水斑的凝胶类物质，取样分析表明从石材底面迁移到石材表面的水泥凝固物中凝胶类物质占70以上，X射线衍射、核磁共振等实验表明水泥的凝胶体为层（网）状结构，其比表面积达到200-15000px/g，仅比水分子大一个数量级。这些凝胶体具有较强的吸水性和的水渗透性，它们占据在石材表面层的微孔隙中。凝胶体细小的微孔中吸附着水分，呈现出半透明状，使表面光的反射率发生变化，粗看起来很像是石材被润湿了。